ملخص الدرس / الثالثة ثانوي/علوم الطبيعة و الحياة/العلاقة بين بنية و وظيفة البروتين/العلاقة بين بنية ووظيفة البروتين
الملخص
من الأستاذ(ة) بوالريش احمدالعلاقة بين البنية الفراغية للبروتين وتخصصه الوظيفي
- يعود هذا التخصص الى اكتسابها فراغيه محدده ,اي تغير في البنيه الفراغيه يؤدي الى فقدان الوظيفه.
ترجع البنية الفراغية للبروتين إلى عدد ، طبيعة و تتالي الأحماض الأمينية المشكلة لها.
1 – الأحماض الأمينية:
أ – تعريف الأحماض الأمينية ٟٕ:
- الأحماض الأمينية مركبات عضوية .
- جميع الأحماض الأمينية )ما عدا الغلايسين( تتكون من ذرة الكربون ) ألفا( مرتبطة بأربع مجموعات مختلفة:
- مجموعتينٌ وظيفٌيتٌينٌ فعالتينٌ، هما :
- مجموعة الأمين (-NH2) القاعدية.
- مجموعة الكربوكسيل (-COOH) الحمضية.
- ذرة الهدٌروجينٌ:
السلسة الجانبيةٌ (R) : متغيرة من حمض أميني إلى آخر .
تصنيف الاحماض الامينيه
- يوٌجد عشرون حمضا أمينٌياٌ أساسياٌ تختلف في مٌا بينٌها في السلسلة الجانبيةٌ (الجذر R).
- لكل حمض أمينٌي اسم لاتينٌي خاص و خٌتصر في الحروف الثلاث الأولى و مٌمكن تصنيفٌها إلى قسمينٌ أساسينٌٌ:
1- الأحماض الأمينية الخطية:
أ - الأحماض الأمينية ذات السلاسل الكربونية:
تابع الاحماض الامينية الخطية
ب - الأحماض الأمينية الهيدروكسيلية:
- تحتوي على وظيفٌة كحوليةٌ
تابع الاحماض الامينية الخطية
د - الأحماض الأمينية الحامضية وأميداتها : تحتوي على وظيفٌتينٌ حمضيتٌينٌ و وظيفٌة أمينٌيهٌ واحدة.
تابع الاحماض الامينية الخطية
ج - الأحماض الأمينية الكبريتية : تحتوي على الكبريتٌ
تابع الاحماض الامينية الخطية
ه -الأحماض الأمينية القاعدية: تحتوي على وظيفٌتينٌ أمينٌيتٌينٌ و وظيفٌة حمضيةٌ واحدة
الأحماض الأمينية الحلقية
أ - الأحماض الأمينية العطرية:
تابع للاحماض الامينية الحلقية
ب - الأحماض الايمينية:
لا يحٌتوي الحمض الأمينٌي برولينٌ على مجموعة أمينٌ NH2 ولكن مجموعة إيمٌينٌ . NH) Imine groupe)
ملاحظة
كما تصنف الأحماض الأمينية حسب السلسلة الجانبية إلى:
- أحماض أمينٌيةٌ قاعديةٌ ( ليزٌينٌ،ارجنينٌ...)
- أحماض أمينٌيةٌ حمضيةٌ ( حمض الغلوتاميكٌ، حمض الأسبارتيكٌ ....)
- أحماض أمينٌيةٌ متعادلة ( سيرٌينٌ ،الغليسٌينٌ..) .
سلوك الاحماض الامينية في الوسط
تسلك الاحماض الامينيه سلوك الاحماض (تعطي بروتونات) و سلوك القواعد (تكسب بروتونات) و ذلك تبعا لدرجة ph الوسط لذلك تسمى الاحماض الامينية بالمركبات الحمقلية .
- الاحماض الامينية هي مركبات حاملة لشحنات.
- تختلف شحنة الحمض الاميني تبعا لدرجة ph الوسط.
تابع لسلوك الاحماض الامينية في الوسط
تمتاز الاحماض الامينية المتعادلة بغياب اية شحنة كهربائية يحملها الشق R . عند درجة الحموضة العالية 1=PH يكون الحمض الاميني تماما مشبع بالبروتونات و يحمل شحنة كهربائية موجبة عند الاضافة التدريجية للقاعدة تبدا مجموعة الكربوكسيل المحمولة فوق الكربون الفا (aC) وهي اكثر حامضية يفقد بروتونها تليها مجموعة الامين
تابع لسلوك الاحماض الامينية في الوسط
- في حاله حمض اميني معتدل هناك ثلاثه احتمالات للشحنة.
تابع لسلوك الاحماض الامينية في الوسط
- في حالة الاحماض الامينية القاعدية هناك اربع احتمالات.
تابع لسلوك الاحماض الامينية في الوسط
- في حالة الاحماض الامينية حامضية هناك 4 احتمالات.
تحديد نوع ومقدار شحنة الحمض الاميني
pH<pHi الوسط : الحمض الأميني موجب الشحنة (+)
pH>pHi الوسط : الحمض الأميني سالب الشحنة (-)
pH=pHi الوسط : الحمض الأميني متعادل الشحنة (0)
- تزداد الشحنة الموجبة والسالبة كلما زاد الفرق بين قيمة pH ى قيمة pHi
- تعريف نقطة التعادل الكهربائي:
هي قيمه من PH عندها يكون الحمض الاميني متعادل كهربائيا (عدد الشحنات الموجبة يساوي عدد الشحنات السالبة),اي محصلة الشحنات الموجبة و السالبة معدومة (0)
تشكل الرابطه الببتيدية
كيفٍية ارتباط الأحماًض الأمينة مع بعضها:
- نظرا لوجود الوظيفتين الحمضية و الامينية في الاحماض الامينية فانهما تتحدان مع بعضهما مع فقدان جزيئة ماء و بذلك اتحاد المجموعة الكربوكسيلية لحمض اميني مع المجموعة الامينية للحمض الاميني الموالي مشكلة رابطة ببتيدية.
- مفهوم الرابطة الببتيدية :
هي رابطه تكافئية قوية بين حمضين امنيين متتاليين وتتشكل بين المجموعه الكربوكسيليه للحمض الاميني الاول مع المجموعه الامنيه للحمض الاميني الموالي مع فقد جزيئة الماء.